Американские биологи разработали алгоритм создания идеальных белков

Американские ученые из университета Вашингтона в Сиэтле разработали алгоритм, который делает возможным создание белков с любой наперед заданной трехмерной структурой.

Программа фактически позволяет предсказывать, какую последовательность аминокислот должен иметь белок, чтобы при сворачивании он принял наперед заданную трехмерную конформацию.

Работа алгоритма состоит, в частности, в анализе множества уже известных структур и применении набора эмпирических правил.

Чтобы протестировать программу, ученые решили создать пять белков, которые не только не встречаются в природе, но и общий вид которых отличается от известных образцов.

Сначала алгоритм устанавливал аминокислотные последовательности-кандидаты, затем лучшие из них отбирали при помощи распределенных вычислений с привлечением волонтеров.

После этого искусственные белки синтезировали в бактериях, выделяли, очищали и отправляли на определение структуры. При этом те ученые, которым было поручено экспериментально установить структуру, ничего не знали о расчетной структуре.

Как оказалось, расчетные и экспериментально установленные трехмерные структуры практически не отличались друг от друга во всех пяти случаях.

Созданные таким способом белки называются идеальными в том смысле, что их последовательность формировалась не эволюционно, а структурным расчетом. Так, если последовательность натуральных белков определяется их функцией и во многом случайна, то у идеальных белков она зависит только от структуры.

Напомним, недавно ученые из Немецкого центра исследования рака обнаружили белок, который влияет на жизнеспособность опухолевых клеток.

Другие новости по теме

Ученые обнаружили белок, поддерживающий жизнеспособность раковых клеток Ученые из Немецкого центра исследования рака обнаружили белок, который влияет на жизнеспособность опухолевых клеток.

Белковые сети бактерий похожи на кольчугу - биологи Ученые установили кристаллическую структуру защитной белковой сети на поверхности некоторых бактерий.

Биологи впервые увидели, как бактерии чинят свои ДНК Микробиологи проследили, как бактериальные клетки исправляют ошибки в цепочку своей ДНК.

Ученые установили молекулярный механизм распространения метастазов Исследователям из Университета Готенбурга впервые удалось получить детальную информацию о роли белка метастазина в распространении опухолевых клеток, сообщает EurekAlert!.

Биологам удалось редактировать геном рыб Биологи разработали метод внесения изменений в геном модельных животных на поздних стадиях развития.